Okay

dann teste mal
Calibre ...
Ist Freeware und gleichzeitig kannst du damit deine Books super verwalten ...
Ist zwar auch nicht die 100%ige ultimative Lösung, da dort gern mal sinnlos grosse Absätze (zw. Kapiteln od. Absätzen mit Leerzeile) eingebastelt werden aber die von dir bemängelte Leerzeichenschwäche ist mit bei Calibre nicht bekannt.
Deine Fehler bei
PDFtoEPUB Authors Promotion kann ich so nicht nachvollziehen, der formatiert zwar Flattersatz, was nicht jedermanns Sache ist und lässt evtl. auch das eine oder andere Trennzeichen stehen (was aber auch an unsauberer Vorlage - sprich "geschützte" Trennzeichen - liegen kann) aber ansonsten gefiel mir persönlich nach kurzem Test das Ergebnis ganz gut
Sowieso gilt bei diesen Umwandlungen: Das Ergebnis kann NIE besser sein, als die Vorlage

wenn die *.pdf schon aus vermurkster, schlechter Quelle gebastelt wurde, kann kein Converter der Welt dies ausbügeln
Ich weiss nicht, was du für pdf-Vorlagen hast (Quelle, Quali), aber wenn du eine 100% sauber erstellte, aus einem TOP-formatierten RTF erstellte testest, kannst du erst dann die Quali der Converter richtig beurteilen
uiuiui ... umfangreiches Thema
MfG,
NeHe